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水產學院前身為水產系，創建于1970年10月，由老干部王士清、王恒負責籌建工作，是全國農業高校中最早成立的水產系，1972開始正式招生。1993年11月18日經國家農業部批準撤系建院。經過四十多年的建設和發展，水產學院在學科建設、人才培養、科學研究、技術推廣等方面都有很大的發展，已成為國內外水產科學高層次創新人才的培養基地和我國水產教育、科研和學術交流中心。

水產學院現有教職工95人，其中專任教師75人（含師資博士后6人），全部具有研究生學歷；具有博士學位教師數71人，占94.7%；其中教授22人，副教授36人；博士生導師18，碩士生導師47人；國務院學位委員會學科評議組成員1人，青年千人計劃獲得者1名，國家優秀青年基金獲得者2人，教育部新世紀優秀人才4人，教育部霍英東基金獲得者1人，湖北省教學名師1人，湖北省杰出青年基金獲得者5人，湖北省楚天學者6人，湖北省高等學校優秀中青年科技創新團隊1個，10多位教師在國內外相關學術機構兼任主任、理事或期刊雜志編委等職務。

學院1978年開始招收本科生，1984年開始招收碩士生，1985年開始招收專科和成人大專函授生，1997年開始招收博土研究生，現有本科-碩士-博士相銜接、完整的水產學科體系，優秀學生可本-碩-博貫通培養。水產養殖專業為國家重點學科和湖北省優勢學科，水產一級學科為湖北省一級重點學科。全國一級學科評估中，水產一級學科連續四次排名第3位。截止2017年底，累計培養本科生5332人，專科生198人，函授生675人，博士生236人、碩土生1459人，本科畢業生中每年有45%以上的人考取研究生。

學院辦學條件優越。水產養殖學為國家特色專業建設點，擁有現代化教學實驗大樓，8套功能性教學實驗室，1個校內教學實習基地，30多個校外教學實習基地，1個國家實驗教學示范中心、農業部淡水生物繁育重點實驗室、農業動物遺傳育種與繁育教育部重點實驗室、農業部水產用獸藥臨床藥效及殘留試驗單位、淡水水產健康養殖湖北省協同創新中心、池塘健康養殖湖北省工程實驗室、湖北省水生動物病害防控工程技術研究中心等科學研究平臺。　　

學院教學科研成果顯著，出版專著、教材和科普書籍共30余部，多媒體教材50余部，其中，3部為面向21世紀課程教材，7部為國家規劃教材，1部為全國高等農業院校優秀教材，《動物生理學》被評為國家精品課程。“十二五”以來，承擔科研項目409項，其中，新批國家自然科學基金70項、國家現代農業產業技術體系崗位科學家5項；新批經費1.71億元；獲得省部級獎勵7項，授權發明專利69項，發表學術論文1697篇，其中SCI收錄780篇，獲得校級以上優秀論文獎80余篇，其中全國百篇優秀博士學位論文提名獎3篇。

學院學風優良，畢業生綜合素質高，適應社會能力強，已形成人才品牌。畢業生供不應求，供需比1：5。畢業生研究生錄取率高，每年一次就業率達到95%以上，連續多年被評為學校就業工作先進集體。

學院資助體系健全，“獎、助、貸、補”聯動助學，還設有廣東海大集團、北京大北農科技集團股份有限公司、武漢通威飼料有限公司、廣州誠一水產科技有限公司、武漢華揚動物保健集團、廣東溢多利生物科技股份有限公司、武漢科洋生物工程有限公司、武漢天辰生物科技有限公司、正大集團、深圳澳華農牧有限公司、武漢回盛生物科技有限公司等企業獎學金和北京漁經生物技術有限責任公司“漁經”獎教金，激勵師生自強不息，奮發前行。

多年來，水產學院與全國多家科研院所廣泛開展學術交流，共同承擔國家、省、部重大項目，建立了密切合作關系。學院每年選派教師到美國、英國、挪威、日本和香港地區等大學和科研單位研修，對外交流合作日益活躍，國際影響不斷提升。