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中國農業科學院研究生院成立于1979年，1981年經國務院批準，成為我國首批博士學位與碩士學位授予單位。

中國農業科學院研究生教育以其分布在全國18個省（市、自治區）的40個研究所為依托，堅持“立足科研、質量為本、科教興農”的辦學理念，以“院所結合、兩段式培養”為特色（研究生院統一組織招生、授課和學位授予，課程學習期間由研究生院實行全方位管理；課程結束后跟隨導師進入研究所開展課題研究，直到完成畢業論文，在所期間，研究生主要由各專業研究所負責管理，研究生院進行輔助管理。），經過30多年的探索和發展，現已形成包括博士、碩士、留學生和專業學位教育在內的多層次、多類型的人才培養體系。截至2018年1月，在讀研究生5105人，其中普通全日制在讀研究生3812人，授予博士、碩士學位13099人，他們為我國農業發展和經濟建設做出了重要貢獻。

中國農業科學院是國家級綜合性農業科研機構，擔負著全國農業重大基礎與應用基礎，應用研究和高新技術研究的任務。全院建有2個國家重大科學工程，6個國家重點實驗室，32個農業部重點開放實驗室，52個中國農業科學院重點開放實驗室；16個國家農作物、畜禽改良中心，1個分中心；5個國家重點野外科學觀測試驗站，24個農業部野外臺站；5個國家工程技術研究中心，5個國家工程實驗室和工程研究中心；3個國家質檢中心， 35個部級質檢中心；1座國家農作物種質資源長期庫，10座中期庫，12座國家農作物圃；1座館藏文獻210萬余冊，33萬余種的國家農業圖書館，建有數據量80G以上的大型農業科學數據庫。“十二五”期間，中國農業科學院以第一完成單位共獲國家科技獎勵成果31項，占全國農業領域授獎總數的22%，其中科技進步一等獎2項，自然科學獎1項，發表論文近2萬篇，其中SCI論文超過6000篇，在《自然》、《科學》系列刊物上發表論文19篇。主持國家級科技計劃項目6600多項，參加各類項目1400項，經費總額達到56億多元，比“十一五”期間增加60%以上。中國農業科學院研究生教育依托全院資源辦學，優良的科研設施設備、大量的前沿課題項目、充足的科研經費、豐富的圖書文獻資源，一流的導師隊伍及廣泛的國際合作交流等，為研究生開展學術研究、參與課題實踐、培養創新能力提供了強大的科研支撐。

建院以來，在上級部門的正確領導和社會各方的大力支持下，研究生教育事業發展迅速。招生規模實現跨越式發展，從首批招收46人，到2017年招收各類研究生1591人，增長33.6倍；學科體系逐步完善，學位授權點從建院初期的26個增長到117個，增長3.5倍，在剛剛結束的第四輪全國學科評估中，我院作物學、植物保護、畜牧學、獸醫學4個學科被評為A+，生物學、農業資源與環境2個學科被評為A-，A類學科占博士學位一級學科授權點的60%。；師資隊伍不斷壯大，導師隊伍從1984年的7名博士生導師發展到2004名研究生導師，其中博士生導師709人（2018年3月），專兼職教師隊伍從建院初期的150人發展到450余人，其中我院導師約占56%；國內外交流與合作從無到有，留學生年招生規模突破200人，在校生規模近400人，已經與世界上多個國家和地區的科研機構、大學建立了合作關系，與比利時列日大學、荷蘭瓦赫寧根大學等高校開展合作培養博士生項目，研究生教育國際化水平不斷提升。

中國農業科學院研究生教育學科專業圍繞農科院八大學科集群建設，優化研究生教育學科體系，現有學科涉及農學、理學、工學、管理學4大門類，涵蓋了18個一級學科，其中有作物學、園藝學、農業資源與環境、植物保護、畜牧學、獸醫學、草學、生物學、生態學、農業工程和農林經濟管理11個博士學位一級學科學位授權點、53個二級學科博士學位授權點；16個碩士學位一級學科學位授權點，64個二級學科碩士學位授權點；另外還有4個專業學位授權資格。

中國農業科學院研究生教育密切關注國際教育發展及科技前沿，積極開展國際合作，已與世界上60多個國家或地區的農業科研機構、大專院校建立了多種形式的雙邊交流與合作關系，與比利時列日大學、荷蘭瓦赫寧根大學等國際知名大學開展中外合作辦學博士研究生項目。研究生院2007年被教育部列為指定接受獲得中國政府獎學金來華留學生院校，2008年首批招收外國留學生11人，目前在校留學生394人，我院研究生教育邁入國際化進程。

中國農業科學院研究生院1999年被教育部和國務院學位委員會授予“全國學位與研究生教育管理先進集體”稱號，2008年獲“北京市學位與研究生教育管理先進集體”。有4篇博士學位論文榮登“全國百篇優秀博士學位論文”，6篇獲提名，2篇獲“北京市優秀博士學位論文”。2002年以來，研究生院以農學門類第一名連續多年榮膺“中國一流研究生院”，在武漢大學發布的2011-2012和2012-2013年度“中國研究生教育評價報告”中，我院綜合競爭力排名進入前三十強。

作為中國農業科學院長遠發展戰略“高層次人才培養基地”的主力軍，研究生院將秉承“明德格物，博學篤行”院訓，追求 “高層次、研究型、國際化、有特色”的辦學目標，努力把研究生院建設成為國內一流、國際知名的培養和造就高層次農業科技人才的重要基地。