一、歷史沿革
中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所于2003年5月由中國農業科學院土壤肥料研究所（成立于1957年8月）與農業自然資源和農業區劃研究所（成立于1979年2月）整合組建而成。是以土壤肥料、農業資源利用和區域發展為主導的國家級公益性綜合研究機構。
二、發展定位和主要研究領域
研究所圍繞現代農業發展和生態文明建設中的國家戰略需求和農業資源環境學科科學前沿，以植物營養與肥料、農業遙感與信息、農業土壤、農業微生物資源與利用、農業生態、農業區域發展為核心研究領域，開展綜合性的基礎與應用基礎研究，為我國農業資源高效利用、動態監測和科學管理，以及農業生態環境建設提供科學支撐和決策依據，推動農業資源與環境學科基礎理論與方法的創新和發展，努力把研究所建成世界一流的農業資源與環境科學綜合研究和高層次人才培養基地。
三、機構設置與科研條件
研究所下設26個機構，管理機構設有辦公室、黨委辦公室（人事處）、科研管理處、財務處、平臺處、肥料評審登記處。服務機構設產業發展中心和后勤服務中心。支撐機構設有土壤肥料測試中心、菌肥測試中心、公共實驗室、期刊信息室和祁陽站、德州站。研究機構建有植物營養、肥料及施肥技術、土壤培肥與改良、土壤植物互作、碳氮循環與面源污染、土壤耕作與種植制度、農業布局與區域發展、農業災情監測與防控、農業遙感與數字農業、草地生態與環境變化、食用菌遺傳育種與微生物資源與利用、農業資源利用與區劃等研究室。
研究所還是耕地培育技術國家工程實驗室、農業部植物營養與肥料重點實驗室、農業信息技術重點實驗室、面源污染控制重點實驗室和農業微生物資源收集與保藏4個重點實驗室和國家化肥質量監督檢驗中心（北京）、農業部微生物肥料和食用菌菌種質量監督檢驗測試中心、中國農業微生物菌種保藏管理中心、農業部微生物產品質量安全風險評估實驗室(北京)、國家微生物資源平臺、全國農業資源信息中心和國土資源農業利用研究中心依托建設單位。是全國農業資源區劃資料庫管理單位，在湖南祁陽、山東德州、內蒙古呼倫貝爾、河北遷西、北京昌平和密云、河南洛陽、河北廊坊、江西進賢和廣東江門建有11個試驗基地，在河北平泉建有國家食用菌改良中心，建有試驗協作網3個。是國家發改委甲級農業工程咨詢資質單位，也是國家遙感中心農業應用部、農業部遙感應用中心研究部、中國農業科學院農業知識產權中心、中國植物營養與肥料學會和中國農業資源與區劃學會的掛靠單位。編輯出版《植物營養與肥料學報》、《中國土壤與肥料》、《中國農業資源與區劃》、《中國農業信息》和《農業科研經濟管理》等學術刊物。
與歐盟聯合研究中心、日本東京大學等32個國際一流大學和研究機構簽訂了合作協議，并建立了穩定的合作領域和交流機制；建有中國農業科學院—根特大學全球變化與糧食安全聯合實驗室、中美可持續農業生態系統研究聯合實驗室、中國農業科學院-國際植物營養研究所植物營養創新研究聯合實驗室、中美區域農業發展合作研究中心等國際合作研究中心、中德農業科技合作平臺、中國農科院-新西蘭皇家科學院林業研究所土壤分子生態學聯合實驗室等國際合作研究中心。
四、人才隊伍情況
截至2016年4月底，全所在職職工286人，其中：中國工程院院士1人，“千人計劃”專家2人，國家“特支計劃”人才1人，“新世紀百千萬人才工程”國家級人選3人，國家杰出青年基金獲得者1人，國家級重大科技項目科學家6人，中國科學院“百人計劃”人才2人，科技部中青年科技創新領軍人才1人，農業部有突出貢獻中青年專家7人，農業部農業科研杰出人才7人，農業部神農計劃人選2人，院青年英才計劃人才5人。院創新團隊首席科學家及團隊14個，高級職稱研究人員168人，碩士研究生導師135名，博士生導師47名，具有博士學位人員162人，碩士學位人員59人。
五、科技創新
研究所科研任務主要包括：國家973、863計劃，國家科技支撐計劃、國家重大專項課題、國家自然（社會）科學基金、農業（行業）科技專項、農業產業技術體系、948、國際合作等項目，2015年承擔各類研究項目353項。建所以來，研究所共獲得國家和省部級科技成果獎勵177項。其中，獲得國家重大科技成果獎4項，全國科學大會獎8項，國家發明獎2項，國家科技進步獎18項，省部級獎146項。獲授權專利217項。出版專著147部,發表論文2755篇（其中SCI/EI論文770篇）。軟件著作權235項；制定國家和行業標準89項（2009年以來）。
六、學科建設與研究生教育
研究所設有農業資源利用學科博士后流動站，是農業資源與利用、生態學、生物學、農林經濟管理、作物學、草學等一級學科博士培養單位，擁有生物化學與分子生物學、生物物理學、作物生態學、植物營養、土壤學、農業水資源利用、農業區域發展、農業遙感、草地資源利用、農業微生物學等18個博士學位授權點；碩士學位授權點有微生物學、生物化學與分子生物學、生物物理學、生態學、環境科學、作物栽培學與耕作學、植物營養學、土壤學、農業水資源利用、農業遙感、農業區域發展、農業經濟管理、農業資源與環境經濟學、農業經營管理等21個專業。培養研究生的學科專業覆蓋農、理、工、管理學等四大門類。
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