該所始建于1959年,原名成都市農業科學研究所,屬地市級科研所,主管單位是成都市農牧局。1983年曾用名成都市蔬菜研究所,1985年10月改為現在的所名——成都市第一農業科學研究所。
建所四十多年來,一直以研究蔬菜為主,同時從事花卉、食用菌、果樹、農副產品加工研究和開發,是四川省乃至西南地區最具有園藝作物研究優勢和特色的專業研究所。通過農科所幾代科研人員的艱苦努力,先后承擔了國家和省、市科研項目150余個,取得了較為優異的成績。1978年被評為先進集體出席全國科學大會,全所共獲科技成果獎128項,其中市級以上科技進步獎68個,星火計劃獎3個,豐收計劃獎29個,引、選出了大白菜、番茄、辣椒、茄子、豇豆、食用菌等蔬菜新品種100多個。據不完全統計,到目前為止,這些品種在長江流域大面積示范推廣種植近200萬畝,取得了顯著的社會經濟效益。為成都市和西南地區的“菜籃子”工程作出了較大的貢獻。
該所目前按照課題主持人負責制,以不同作物設立了9個研究組,涵蓋了冬瓜、茄子、豇豆、辣椒、甘藍、大蒜、食用菌、馬鈴薯、苦瓜、特菜、花卉、園林綠化、無公害蔬菜檢測等。